Organy  Sądu:

- Prezes Sądu Rejonowego w Nakle nad Notecią- Wojciech Kokociński

- Dyrektor Sądu Okręgowego w Bydgoszczy- Przemysław Kruszczyński

- Zastępca Dyrektora Sądu Okręgowego w Bydgoszczy - Dariusz Sokołowski

 Zadaniem Prezesa Sądu jest:

1. kierowanie sądem i reprezentowanie go na zewnątrz,
2. pełnienie czynności z zakresu administracji sądowej,
3. powierzenie sędziom pełnienia funkcji i zwalnia  z ich pełnienia, po zasięgnięciu wymaganych opinii,
4. przyjmowanie skarg i wniosków z zakresu nadzoru administracyjnego,
5. ponadto jest zwierzchnikiem służbowym sędziów danego sądu.